利用 Vesta 软件绘制团簇构型 ICO多面体(二)

2024-01-10 09:36:56

图片


微信公众号原子与分子模拟更新的快,欢迎大家关注。

--------------------------------------------------------------------

进入网站下载 ICO 文件:

http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/

图片

利用 Vesta 软件进行绘制。

这个网址是关于键序参数分析的一个程序,感兴趣的可以看一下,官网里有详细的介绍。

文章题目:Melting of icosahedral gold nanoclusters from molecular dynamics simulations

文章链接:http://dx.doi.org/10.1063/1.1917756

Program title:?Bond Order Parameters (bop)

软件网址:?

http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/

键序参数法(Bond-orientational Order Parameter,BOP)是通过分析原子构型的对称性来识别不同构型的原子。为了确定体系的最终构型,采用基于球谐函数的键序参数Ql来区分固体构型和液体构型,其范围是从0到1。为了进一步考察晶体熔化前后的微观结构,BOP是Steinhardt等提出研究熔化的常用分析手段,也被用来表征全局原子结构和长程结晶顺序。通过计算平均键合取向序参量Qlm,可以方便地得到第二阶Ql和第三阶Wl的旋转不变量。

--------------------------------------------------------------------

图片

以上是我们分享的一些经验或者文章的搬运,或有不足,欢迎大家指出!

如有侵权,请联系我立马删除!

?欢迎大家关注微信公众号原子与分子模拟

文章来源:https://blog.csdn.net/nmrwxw/article/details/135494097
本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。