DSSAT作物模型建模方法与进阶基于Python语言快速批量运行DSSAT模型及交叉融合、扩展应用技术应用

2023-12-20 17:08:11

随着数字农业和智慧农业的发展,基于过程的作物生长模型(Process-based Crop Growth Simulation Model)在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农业碳中和、农田固碳减排等领域扮演着越来越重要的作用。Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程,被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。DSSAT模型内核算法是基于Fortran语言开发的,软件界面是基于C++进行开发。了解和熟悉DSSAT模型的关键算法和软件的操作是学习DSSAT模型的基础。此外,想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才,除了掌握对作物模型相关知识之外,还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Python是一门应用场景广泛、简单易学的程序语言,在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。

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第一部分:DSSAT模型建模实践技术应用内容?

专题一、DSSAT模型与高级应用

  1. 作物生长模型的概念
  2. 作物生长模型的发展现状
  3. DSSAT模型的开发历程
  4. DSSAT模型的模块及模拟流程
  5. 作物生长模型的前沿应用

作物生长模型的算法改进

作物生长模型站点尺度和栅格尺度的模拟

作物生长模型与机器学习的集成

作物生长模型与遥感、表型数据的同化

专题二、DSSAT模型安装与编译

1 DSSAT模型操作

  1. DSSAT的安装
  2. DSSAT模型操作界面讲解

2 DSSAT模型源码操作与编译

  1. DSSAT模型源码安装
  2. DSSAT源码的介绍与修改

DSSAT源码的编译

专题、DSSAT气象文件准备

DSSAT自带的气象数据的准备

  1. DSSAT气象文件的介绍
  2. 日照转辐射算法

DSSAT气象文件转化

专题四、DSSAT模型的物候发育模块

DSSAT生育期算法

  1. DSSAT模型的生育期尺度
  2. DSSAT模型的积温计算
  3. DSSAT模型的生育期算法

DSSAT模型的生育期影响因子及算法

专题五、DSSAT土壤文件准备

1 DSSAT模型的土壤输入参数

2?DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算

3?DSSAT模型土壤输入文件准备

专题、DSSAT土壤水-碳-氮模块

1 DSSAT模型的土壤模块

2 DSSAT模型土壤水分模块的主要算法

3 DSSAT模型土壤养分动态过程模拟及N2O排放的模拟

4 DSSAT模型土壤碳库模型及土壤有机碳SOC的模拟

土壤CO2排放和土壤有机碳的模拟

专题七、DSSAT管理文件准备

1?DSSAT模型的农田管理措施的准备

  1. 氮素的矿化和固定过程
  2. 氮素的硝化作用与反硝化作用
  3. 土壤N2O的模拟
  4. 土壤磷动态与模拟
  5. 土壤碳库模型的发展历程
  6. 土壤碳的周转模型
  1. DSSAT模型播期和播种密度设置
  2. DSSAT模型施肥设置(化肥+有机肥)
  3. DSSAT模型的灌溉设置
  4. DSSAT模型秸秆还田设置

2?DSSAT模型的作物生长模拟

  1. 光温潜在产量的模拟

不同管理措施下作物生长的模拟

专题八、DSSAT作物生长模拟算法

1?DSSAT模型光合生产和物质分配算法

2?DSSAT模型产量形成算法

3?DSSAT模型养分吸收、分配和养分效应算法

4?DSSAT水分效应算法

专题九、DSSAT作物参数设置和优化

1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数

2 DSSAT软件自带的参数优化方法

3 DSSAT软件自带的参数敏感性分析方法

专题?DSSAT模型结果分析与模型评价

1 对DSSAT模拟的模拟结果进行分析

2?对模拟结果的进行模型评价

3?对模型的结果进行做图

专题一、更多案例模拟与疑难解答

1?不同作物、不同情景的模拟

2?实例回顾、训练、巩固

3?答疑与讨论(大家提前把问题整理好)

第二部分进阶:基于Python语言快速批量运行DSSAT模型及交叉融合、扩展应用技术

专题一、Python语言与数据科学

1 Python语言与数据科学

  1. python语言发展脉络
  2. Python语言在作物模型中的应用

2 1 Python软件安装及入门

  1. Anaconda软件安装
  2. Python库的安装与基本语法
  3. Python的字符操作与正则表达式
  4. Python的数据清洗与存储

各种数据格式的读写及操作

专题、Python准备DSSAT气象文件

1?Python操作和准备气象文件

  1. DSSAT气象文件的编写分析
  2. 使用Python编写DSSAT气象文件
  3. 日照转辐射算法的编写

DSSAT气象文件的批量转化

专题三、Python准备DSSAT土壤文件

1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数

2?使用Python近似估算土壤输入参数

3?使用Pyhon语言操作和准备土壤输入文件

4?使用Python快速批量生产土壤文件

5?使用Python调用全球土壤数据库的数据并转化成DSSAT土壤文件

专题四、Python准备DSSAT管理文件

1 使用Python对农田管理措施(播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等)进行设置

2?使用Python进行管理文件批量准备(只需要填写excel,就能批量模拟)

专题五、Python准备DSSAT参数文件及批量模拟文件

1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数

2 主要的参数优化方法

3 使用Python语言进行参数文件准备

4 使用Python语言对批量模拟文件的编写

专题六、Python对模拟结果进行数据清洗、整理

1?使用Python读取DSSAT文件的模拟结果

2?对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

专题七、Python对模拟结果进行数据分析及绘图

1 使用Python对模拟结果进行分析

2?使用Python计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值

3?使用Python对模拟结果进行可视化(模拟结果的动态图和1:1图等)

专题八

  1. 学员根据科研或生产实际,提供数据,集体讨论DSSAT的高级应用方案
  2. 提供若干附加材料,包括典型论文、其它软件以及学习材料
  3. 实例回顾、训练、巩固

答疑与讨论(大家提前把问题整理好)

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文章来源:https://blog.csdn.net/zhkjjww/article/details/135109451
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