.raw 是一个 Anndata 包中的对象,用于存储原始的单细胞数据。scanpy种如何查看 .raw 对象的内容,

2023-12-23 06:17:42

1查看 .raw 对象的内容,可以使用以下方法:

.raw 是一个 Anndata 包中的对象,用于存储原始的单细胞数据。

  1. 使用 .X 属性查看原始数据矩阵:.raw.X 这将返回一个 Numpy 数组,其中包含原始数据的数值。

  2. 使用 .var_names 属性查看原始数据的变量(特征)名称列表:.raw.var_names 这将返回一个包含变量名称的列表。

  3. 使用 .obs_names 属性查看原始数据的观测(样本)名称列表:.raw.obs_names 这将返回一个包含观测名称的列表。

  4. 使用 .var 属性查看原始数据的变量(特征)注释信息:.raw.var 这将返回一个 Pandas DataFrame,其中包含有关每个变量的详细注释信息。

  5. 使用 .obs 属性查看原始数据的观测(样本)注释信息:.raw.obs 这将返回一个 Pandas DataFrame,其中包含有关每个观测的详细注释信息。

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文章来源:https://blog.csdn.net/qq_52813185/article/details/135120668
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