R语言【CoordinateCleaner】——cc_gbif(): 根据通过 method 参数定义的方法,删除或标记地理空间中异常值的记录。

2024-01-02 10:22:39

cc_gbif()是R语言包coordinatecleaner中的一个函数,用于清理GBIF(全球生物多样性信息设施)数据集的地理坐标。该函数可以识别潜在的坐标错误,并对其进行修正或删除。

以下是cc_gbifl()函数的一般用法和主要参数:

cc_gbif(data, species = NULL, geometry = c("point", "polygon"), geometry_column = NULL, latitude_column = "decimalLatitude", longitude_column = "decimalLongitude", coordinate_precision_column = NULL, bounding_box = NULL, geographic_extent = NULL, keep_records_without_coordinates = TRUE)

参数说明

  • data: 输入的数据框或数据表,包含GBIF数据集。
  • species: 可选参数,用于筛选特定物种的观测记录。默认为NULL,表示使用所有物种的记录。
  • geometry: 指定数据集的几何类型,可以是"point"(点)或"polygon"(多边形)。如果数据集是点集,则几何类型应设置为"point"。如果数据集是多边形(如网格区域),则几何类型应设置为"polygon"。默认为"point"。
  • geometry_column: 数据集中存储几何信息的列名。默认为NULL,表示函数将自动检测列名。
  • latitude_column: 纬度信息所在的列名,默认为"decimalLatitude"。
  • longitude_column: 经度信息所在的列名,默认为"decimalLongitude"。
  • coordinate_precision_column: 坐标精度信息所在的列名,用于检测坐标错误。默认为NULL,表示不使用该列进行错误检测。
  • bounding_box: 可选参数,指定限制数据集的边界框(经度范围和纬度范围)。默认为NULL,表示不限制边界框。
  • geographic_extent: 可选参数,指定限制数据集的地理范围(国家、大陆等)。默认为NULL,表示不限制地理范围。
  • keep_records_without_coordinates: 一个逻辑值,表示是否保留没有坐标信息的记录。默认为TRUE,即保留这些记录。

函数功能

cc_gbif()函数用于对GBIF数据集进行清理和修正,以消除潜在的坐标错误。它可以识别并修复以下类型的坐标问题:

  1. 重复的坐标:如果数据集中存在相同的坐标点,函数会将其合并为一个唯一的坐标点。
  2. 空白坐标:如果数据集中存在缺失的坐标点,函数会删除这些记录。
  3. 错误的坐标范围:函数会通过比较坐标点与世界各地的实际范围进行验证,并删除超出范围的记录。
  4. 错误的坐标精度:如果提供了坐标精度信息(通过coordinate_precision_column参数),函数会根据精度信息检测可能的坐标错误,并进行修正或删除。

cc_gbif()函数是R语言包coordinatecleaner中的一个功能强大的函数,用于清理GBIF数据集中的地理坐标。它可以识别并修复重复的坐标点、空白的坐标点以及超出范围的坐标记录。此外,该函数还可以利用提供的坐标精度信息来检测可能的坐标错误,并进行修正或删除。

使用cc_gbif()函数时,用户可以通过指定特定物种的观测记录、几何类型(点或多边形)、存储几何信息的列名等参数来定制化处理。还可以选择限制数据集的边界框或地理范围。函数还提供了一个选项,决定是否保留没有坐标信息的记录。

通过使用cc_gbif()函数,用户可以有效地清理和纠正GBIF数据集中的地理坐标,提高数据的质量和准确性。这对于生物多样性研究、生态分析和地理信息系统应用都非常有价值。

文章来源:https://blog.csdn.net/whitedrogen/article/details/135325639
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