Linux使用circos

2023-12-24 12:17:06

1.在conda中安装bioconda

conda install -c bioconda circos -y
# 测试是否所有的module都安装好了
circos -module
# 所有都显示OK则成功
ok       0.39 Font::TTF::Font
ok       2.68 GD
ok       0.2 GD::Polyline
...      ....

2.检查模块是否齐全 circos -module

3.下载

wget http://www.circos.ca/distribution/circos-0.69-9.tgz
tar -zvxf circos-0.69-9.tgz

4.测试

可以用自带的例子测试一下?

cd circos-0.69-9/example/
../bin/circos -conf etc/circos.conf

运行成功之后，会在当前目录生成circos.png和circos.svg两张图片。

参考:?生信 | Circos的安装 - 简书 (jianshu.com)

文章来源:https://blog.csdn.net/qq_54867493/article/details/135170147
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