富集分析后得到很多term，选谁为研究方向：直播分享不同大语言模型的回答（Claude、ChatGPT3.5、Gemini）

大家好，今天生信小博士再来聊一聊：如何选择富集分析的term进行下一步研究。如果你不想看文字，可以本周日晚八点十分来我视频号直播间一起聊聊，到时会有代码实战与经验分享。欢迎预约~

我用同样的问题，问了不同的大预言模型，目前个人感觉claude最靠谱，贴合实际。

我的问题：在生信分析时，我富集分析之后得到很多term，应该选择哪个或者哪些作为我的研究方向呢

01claude的回答，和我的想法一样，我很喜欢

图片看不清楚的话：

在生信分析得到的富集结果中选择研究方向时,以下几点建议可以参考:

1. 根据P值和富集程度选择统计学意义最显著的term。P值越小,富集倍数越大的term,统计学意义越可靠。

2. 根据当前研究热点,选择那些研究前沿性强的term。可以在PubMed等数据库中搜索这些term的研究文章数量变化,判断其热度。

3. 根据期刊方向,选择发表容易的term。不同期刊对某些研究方向的关注点有偏向,可以匹配自己目标期刊的方向选择term。

4. 根据自身条件和基础,选择操作难易适中的term。过于尖端或技术要求过高的term不容易开展研究。

5. 综合以上多个方面,从中筛选出2-3个作为主要研究方向更为合适。既考虑可行性,也兼顾创新性。

6. 必要时可咨询导师、专家,根据他们研究经验提供的意见调整或改进选择。

希望这些建议可以对你的研究方向选择有所帮助。选择合适的方向非常重要,欢迎在分析和决策过程中与我讨论交流。

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02相比之下Gemini的回答，更全面，甚至提供了多个答案，供你选择

（google? Gemini的回答，目前还是测试版的bard）

2.5如果你仔细看，就会发现Gemini答案的旁边有 view?other drafts，提供了多个答案供选择

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看不清图片的话：在生信分析时，富集分析得到的term可以帮助我们理解研究对象的生物学功能和机制。在选择研究方向时，可以考虑以下几个因素：

1. 富集程度：富集程度越高，表明该term在差异基因中所占比例越大，与实验结果的相关性越高。因此，可以优先选择富集程度较高的term。

2. p值和FDR值：p值越小，FDR值越小，表明该term富集的结果具有统计学意义。因此，也可以优先选择p值和FDR值较小的term。

3. 与研究背景的相关性：如果研究背景已经明确，那么可以选择与研究背景相关的term。

4. 与自身研究兴趣的相关性：研究方向的选择也应该符合自身的研究兴趣。如果选择自己感兴趣的领域，那么研究起来也会更加有动力。

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具体来说，可以按照以下步骤进行选择：

1. 首先，可以根据富集程度和p值/FDR值，将term进行筛选，保留富集程度较高且p值/FDR值较小的term。

2. 然后，可以对筛选出的term进行进一步分析，包括查阅文献、与专家交流等，了解这些term的生物学功能和机制。

3. 最后，根据研究背景和自身研究兴趣，选择合适的term作为研究方向。

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以下是一些具体的建议：

1. 如果研究背景比较宽泛，可以选择富集程度较高且与研究背景相关的term。

2. 如果研究背景比较明确，可以选择与研究背景高度相关的term。

3. 如果研究兴趣比较广泛，可以选择富集程度较高且自己感兴趣的term。

4. 如果研究兴趣比较明确，可以选择与研究兴趣高度相关的term。

当然，在选择研究方向时，还需要考虑其他因素，例如实验条件、研究资源等。最终的选择应该综合考虑各方面因素，并做出最适合自己的决定。

03 相比之下，chatgpt说的全是废话。（当然，我们可以通过更改prompt让他更有针对性的回答。为了节约时间，我就不演示了）

chatgpt3.5的回答

诡异的是，不同平台提供的gpt3.5接口得到的答案很不一样

看完记得顺手点个“在看”哦！